UNICEF is een semi-autonoom VN-fonds met een eigen administratie en eigen middelen. UNICEF is voor zijn werkzaamheden en de financiering van zijn activiteiten voor 100 procent afhankelijk van vrijwillige bijdragen. Binnen de structuur van de Verenigde Naties rapporteert UNICEF rechtstreeks aan de Raad van Bestuur van de Verenigde Naties.
Jaarlijks worden de rekeningen en het activiteitenrapport van UNICEF beoordeeld door de ECOSOC, de Economische en Sociale Raad van de VN.
UNICEF heeft momenteel bijna 14.000 medewerkers in dienst (het personeel van de nationale comités voor UNICEF niet meegerekend). Meer dan 85% van het personeel werkt op het terrein. Een even groot percentage van het UNICEF-personeel wordt lokaal gerekruteerd in de landen waar UNICEF in actie is.